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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
《西游记之七十二变》上映 这个孙悟空是按照黄渤打造的******
亲子动画电影《西游记之七十二变》将于12月30日上映，该片监制刘晓光和导演覃劼此前曾经参与打造了《西游记之大闹天宫》《西游记之孙悟空三打白骨精》等西游题材的创作，在接受北京青年报记者专访时，导演覃劼表示，该片在原著基础上展开想象，讲述了三星洞仙法学院里，孙悟空的热血阳光，而刘晓光则透露，孙悟空的形象和神态参考了黄渤的样子，“我跟黄渤说，这个悟空是按照他来打造的，有点‘丑萌’。”
《西游记之七十二变》的剧情选择了原著中的第一回、第二回章节，讲述孙悟空三星洞学艺，影片将原本短篇幅的故事进行重新扩展和演绎，片中孙悟空和牛魔王、狮驼王、金角银角成为了从小学仙法的同学，共同学习七十二变仙家法术，逗趣的校园日常充满欢乐。从之前发布的海报可以看到，他们每一个人的手中都握有仙家兵器至尊金箍棒，展现出自己征服金箍棒的决心，看来这个故事中，将有一场激烈的金箍棒争夺。而随着一个巨大的阴谋浮出水面，反派东海龙王与孙悟空争夺金箍棒的野心展露无疑，仙界和龙族的大战一触即发。小悟空经历磨炼，从懵懂的法术小白，成长为精通七十二变的一代大英雄齐天大圣。
刘晓光表示，这部影片填补了西游题材的空白，“之前的《大闹天宫》《三打白骨精》，大家已经耳熟能详了，但是，在这部影片里，我们讲述的是各方妖怪神仙不再是取经路上的拦路虎，而是将和孙悟空一起进入三星洞仙法学院求学，这个过程充满未知和新鲜感。”
作为一部贺岁档动画片，《西游记之七十二变》主打全年龄层，刘晓光表示，目前，第二部已经开始创作，“我们在创作中，衍生出丰富的灵感和素材，希望能够打造系列动画。”而覃劼也表示，三星洞的想象空间是可以进一步打开的。（文/记者肖扬）
（文图：赵筱尘 巫邓炎）
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