提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
第十二届鸟巢欢乐冰雪季开幕 设置20余项冰雪健身活动******
中新网北京1月18日电 (记者 陈杭)第十二届鸟巢欢乐冰雪季18日在京拉开帷幕,以“冰雪鸟巢·悦享双奥”为主题,在国家体育场附场3.4万平方米的冰雪乐园中设置了20余项冰雪健身活动,将持续至2月中下旬。春节期间,鸟巢还将首次推出“到鸟巢过大年”文化体育休闲活动。
图为第十二届鸟巢欢乐冰雪季活动现场。 中新社记者 韩海丹 摄北京国资公司所属国家体育场鸟巢相关负责人介绍,第十二届鸟巢欢乐冰雪季是唯一一个在“双奥开闭幕式场馆”举办的大众冰雪品牌活动,也是鸟巢在北京2022年冬奥会后首个面向社会开放的冬季品牌项目,旨在持续推广冰雪运动,丰富群众健身和运动休闲方式,激发大众冰雪运动热情。
图为第十二届鸟巢欢乐冰雪季活动现场。 中新社记者 韩海丹 摄本届欢乐冰雪季以“冰雪鸟巢·悦享双奥”为主题,将持续至2月中下旬,在国家体育场附场3.4万平方米的冰雪乐园中,设置了高台滑雪、雪山大冒险、雪上飞碟、雪地CS、雪地摩托、雪地香蕉船、缤纷五环、旋转飞碟、雪地大碰撞等20余项冰雪健身活动。
图为第十二届鸟巢欢乐冰雪季活动现场。 中新社记者 韩海丹 摄开幕现场,来自北京东城冰雪特色校的学生们在雪地开展了平地滑雪接力追逐赛,首批滑雪冬令营的孩子也列队登上了高台滑雪雪道,开启雪上飞驰。本届欢乐冰雪季首次将高台滑雪项目设置在了火炬广场一侧。作为奥运场馆内的优质初级道雪场,鸟巢高台滑雪项目占地5000平方米,可同时容纳300人滑雪。滑雪爱好者可登上高台体验畅意飞驰,也可与鸟巢全景及奥运火炬同框打卡。
图为第十二届鸟巢欢乐冰雪季活动现场。 中新社记者 韩海丹 摄在今年春节期间,鸟巢还将首次推出“到鸟巢过大年”文化体育休闲活动,包括富有双奥特色和喜庆色彩的旅游线路,“辉煌·逐梦——双奥之路中华体育文化展”、青少年冰雪艺术创作图片展,温馨年夜饭、猜灯谜等活动。
图为第十二届鸟巢欢乐冰雪季活动现场。 中新社记者 韩海丹 摄据悉,在北京国资公司支持下,作为国家体育场自主策划的标志性全民健身活动,鸟巢欢乐冰雪季举办12年来,已累计吸引超过230万人次参与。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |